服務(wù)名稱: 同位素標記定量
服務(wù): 4-6周
規(guī)格: 實驗服務(wù)
價格: 500元
同位素標記定量:
iTRAQ (isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation) &TMT (Tandem Mass Tags)分別由AB Sciex公司和Thermo公司研發(fā)的多肽體外標記定量技術(shù),利用多種同位素試劑標記蛋白多肽N末端或者賴氨酸側(cè)鏈基團,不同分子量的試劑對不同來源的樣品進行標記從而實現(xiàn)不同樣品間蛋白質(zhì)組的比較。
iTRAQ實驗步驟:
1.樣品準備:將待測樣品進行定量計算出樣品蛋白濃度;
2.蛋白還原烷基化及酶解:每組樣品各取100μg按照iTRAQ試劑盒要求進行處理,使用測序級胰蛋白酶溶液酶解后,超濾管離心收集酶解肽段;
3. iTRAQ標記:將ITRAQ試劑平衡到室溫,用150μL異丙醇溶解,取酶解肽段加入iTRAQ試劑后室溫反應(yīng)2 h,加入水終止反應(yīng),等量混合不同組樣品,真空冷凍干燥樣品: .
4. LC-MS-MS分析:使用Thermo的Q-Exactive Orbitrap進行串聯(lián)質(zhì)譜鑒定。
5.數(shù)據(jù)處理及生信分析
結(jié)果展示:
全局分析聚類熱圖
TOP10的蛋白數(shù)目統(tǒng)計分析
實驗周期及交付標準
1.實驗周期: 4-6周
2.交付標準:蛋白定量結(jié)果、鑒定結(jié)果、質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)、生信分析結(jié)果(G0分析. KEGG分析等等)
需確認的信息
1.樣本的種屬
2.樣本的類型(組織or細胞or血液)
3.樣本的數(shù)量及分組
4.分析要求
參考文獻
[1]XuX,Zhu Q,Zhang R,et al. ITRAQ-Based Proteomics Analysis of Acute Lung Injury Induced by Oleic Acid in
Mice[J]. Cellular Physiology and Biochemistry, 2017:1949-1964.
[2]QuZ, GaoF , LiL, et al. Label-Free Quatitative Proteomic Analysis of Diferentially Expressed Membrane Proteins
of Pulmonary Alveolar Macrophages Infected with Highly Pathogenic Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome
Virus and Its Attenuated Strain[J]. PROTEOMICS, 2017:1700101.
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實驗代做: