10分文章中的RNA pull-down如何七十二變
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長鏈非編碼RNA(lncRNA)是一類轉錄本長度超過200nt的RNA分子,它們并不編碼蛋白,而是以RNA的形式在多種層面上(表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等)調控基因的表達水平。近年來的研究表明,lncRNA參與了細胞分化、細胞凋亡、免疫應答以及發育等多個生物學過程。在腫瘤細胞中,某些特定的lncRNA的表達水平會發生改變,這種表達水平的變化能夠作為癌癥診斷的標志物(有時是非常靈敏的診斷標志物,如前列腺癌中的DD3)和潛在的藥物靶點。
雖然近年來關于lncRNA的研究進展迅猛,但是絕大部分的lncRNA的功能仍然是不清楚的。因此lncRNA的研究是一片非常廣闊的未知領域,具有極大的科研價值和意義,其中RNA Pull-down技術為lncRNA生物學功能的驗證起到了至關重要的作用。RNA Pull-down結合了體外轉錄與生物素標記、質譜技術,是研究非編碼RNA與蛋白質相互作用的一大利器。
最近發表在Cancer Res(IF 9.122) 以及HEPATOLOGY(IF 13.246)雜志上的2篇文章:“MetaLnc9 Facilitates Lung CancerMetastasis via a PGK1-Activated AKT/mTOR Pathway”以及“Long Noncoding RNA TSLNC8 Is aTumor Suppressor That Inactivates the Interleukin-6/STAT3 Signaling Pathway”,都是采用RNA Pull-down結合體外轉錄、生物素標記和質譜技術來研究lncRNA在腫瘤細胞增殖和侵襲過程中的功能以及分子機制。